Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms