Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms