Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms