Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RELAQ04206 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms