Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms