Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms