Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms