Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms