Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms