Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms