Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms