Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms