Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52P55327 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52P55327 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms