Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCL1P53675 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms