Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms