Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX2P52951 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms