Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX2P50458 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LHX2P50458 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LHX2P50458 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms