Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMPHP49418 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMPHP49418 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPHP49418 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPHP49418 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms