Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms