Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC1P33527 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms