Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms