Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms