Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPREP23469 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPREP23469 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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