Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms