Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AMY2BP19961 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms