Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms