Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFTRP13569 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms