Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH1P12830 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms