Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms