Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF1P10914 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF1P10914 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF1P10914 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF1P10914 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF1P10914 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms