Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD1P0DJD0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD1P0DJD0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms