Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms