Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NGFRP08138 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms