Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13BP05160 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13BP05160 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13BP05160 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms