Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms