Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms