Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRMUO75648 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMUO75648 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms