Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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