Protein–RNA interactions for Protein: O43281

EFS, Embryonal Fyn-associated substrate, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFSO43281 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFSO43281 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFSO43281 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFSO43281 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms