Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C2AO00443 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms