Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms