Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A8MVJ9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A8MVJ9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A8MVJ9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms