Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms