Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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