Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms