Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms