Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS5Q9UPZ3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms