Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IGSF9BQ9UPX0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms