Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms