Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRL2Q9UJC5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms